El Hospital Iquitos “Cesar Garayar García” de Iquitos, fue inaugurado el 21 de julio de 1,945, durante el segundo período del presidente de la República, Dr. Manuel PRADO UGARTECHE, quien firmó un convenio con el Servicio Cooperativo Interamericano de Salud Pública de Estados Unidos de Norte América (EEUU) cuya oficina funcionaba en la calle Pevas 1° cuadra, para brindar atención médica integral a la población de Iquitos. Estas obras fueron ejecutadas por los maestros de obras de apellido Riera y don Antonio Rúas, capacitados en Europa. El incendio del 25 de agosto, en las instalaciones cercanas al Mercado Central, hace decidir al Dr. Hans COLBER la ocupación definitiva de sus antiguas instalaciones, designando como administrador a Mr. Berkley, y como sus primeros trabajadores a: don Gustavo VASQUEZ FREITAS, Enfermera Mery HEBANAIS, Ing. Sanitario Carlos SALMON, 10 técnicas de Enfermería y 5 visitadoras sociales (Actualmente Trabajadoras Sociales).
Por aquel tiempo se estaba desarrollando la Segunda Guerra Mundial y los EE.UU. hacían lo posible para ganarse las simpatías de los países latinoamericanos, pero al mismo tiempo buscaban establecer un sistema de extracción cauchera, que pudiera equipar a los fabricantes de armamentos por medio de la Agencia Estatal Internacional. Fue en esa ocasión y dentro del mismo Programa de Asistencia, cuando se crea el Servicio Cooperativo Internacional de Salud Pública (CISP), encargado de combatir las enfermedades tropicales y promover la salud.
En el año 1947 se hace cargo de la Dirección de este Hospital el primer médico peruano, el Dr. Atkins MORALES, quien, a los pocos días y por disposición de la superioridad, pasa a ocupar la Jefatura de la Unidad Sanitaria de Loreto (actual GERESA Loreto), reemplazándolo el Dr. Dámaso GONZALES RODRIGUEZ, eminente cirujano, que permanece durante 09 años en la Dirección. Cabe señalar que en esa época la Seguridad Social inicia su atención a los asegurados en las instalaciones de este Hospital. Lo sucedió el Dr. Félix ARRIETA COHELO recordado por su extrema rectitud. Se cuenta que fue destituido por no aceptar a una recomendada del ministro de salud de entonces. Después de 10 años de servicios, fue reemplazado por el Dr. Jorge SIBINA SIBINA hasta el año 1970, al que lo reemplaza el Dr. Francisco MOURA TUANAMA, quien decide la remodelación y ampliación de local con el apoyo de la Beneficencia Pública que construye el pabellón de Medicina, y el Club de Leones de Iquitos construye el pabellón para el banco de sangre, donde funcionaba la farmacia central. En 1983 se le denomino como Hospital Apoyo Iquitos. A partir del año 1,972, se suceden los siguientes directores:
El 26 de noviembre del 2003, con Resolución Ejecutiva Regional N° 1358-2003-GRLP, es aprobada como establecimiento de mediana complejidad Nivel II – 2. Al presente el Hospital Iquitos “Cesar Garayar García”, tiene una antigüedad de 78 años, pues su infraestructura ha culminado su vida útil, considerándose necesario la demolición y la reconstrucción de un nuevo edificio. El cual fue autorizada a través del Contrato No 014-2016-GRL-GRL. Este contrato materia de la Licitación Publica No 0102015-GORELORETO, contempla la elaboración del expediente técnico, la ejecución de la infraestructura y montaje del equipamiento médico. Todo a cargo del Contratista Consorcio Salud Loreto, conformada por las empresas: Impresa Pizzarotti C.S.P.A.
El Hospital Apoyo Iquitos, ha logrado la Certificación a nivel nacional como el Primer Hospital de provincia que cumple con la “Implementación de los 10 Pasos para un Parto Seguro” y para “Una Lactancia Materna Exitosa”. Actualmente hay logros importantes en esta gestión que, con el apoyo de las autoridades del MINSA, Gobierno Regional de Loreto, y Organismos de Apoyo Social y Recursos Propios de la Institución, trabajamos por cumplir la Misión de nuestro Hospital, que es la de brindar servicios integrales de salud, a niños, adolescentes, adultos, priorizando a la población urbano y rural, satisfaciendo las necesidades de salud sentidas y no sentidas en forma oportuna con equidad, calidad y calidez.
En cumplimiento del Convenio Marco de Cooperación Interinstitucional entre el Gobierno Regional de Loreto y el Ejército del Perú; el Hospital Iquitos “Cesar Garayar García”, se encuentra utilizando en calidad de cesión de uso, una parte de las instalaciones de la IPRESS millitar “Santa Rosa” y en ella se realizan las actividades asistenciales; mientras que las administrativas, se llevan a cabo en el módulo de contingencia explanada GORE-Loreto ,mientras dure la ejecución del proyecto de construcción en cuanto a infraestructura y equipamiento biomédico del nuevo hospital.